Биолог, музейный деятель, преподаватель кафедры ботаники агрономического факультета Ярославского университета (1921—1924). Родился в селе Никольское Угличского уезда Ярославской губернии в семье чиновника. По окончании Ярославской гимназии в 1909 г. поступил на естественное отделение физико-математического факультета Московского университета. В 1911 г. перевелся в Петербургский университет, во время учебы работал на Мурманской биологической станции, изучая планктон Кольского залива. С 1912 г. являлся членом-сотрудником, а затем действительным членом Ярославского естественно-исторического общества, изучал флору Ярославской губернии. С 1918 г. проживал в г. Данилове Ярославской губернии и работал в педагогическом техникуме. С 1921 г. по 1924 г. работал преподавателем на кафедре ботаники агрономического факультета Ярославского университета, одновременно заведовал музеем Ярославского естественно-исторического общества (1922—1925). После закрытия университета в 1924 г. преподавал в Ярославском педагогическом институте, с 1931 г. по 1947 г. заведовал кафедрой ботаники. Публиковался в «Трудах Ярославского естественно-исторического общества» и «Ученых записках Ярославского педагогического института». Умер в Ярославле.

Гущина Е. В. Биографический сборник Демидовского университета / Е. В. Гущина, Д. К. Морозов, Ю. Г. Салова. — Ярославль, Рыбинск: Изд-во «Рыбинский Дом печати» — С. 220-221.

1. Шаханин, Н. И. О морских элементах зоопланктона озера Могильного (Мурман, остров Кильдин) / Н. И. Шаханин. — Петроград: Тип. «Печатный труд», 1916. — С. 184—203.
2. Шаханин, Н. И. Растительность Ярославской губернии общий обзор / Н. И. Шаханин // Природа Ярославского края. Труды ЯЕИКО. — Ярославль, 1926. — Т. 5 из Вып. 2. — С. 29—46.
3. Шаханин, Н. И. Растительность и животный мир Даниловского уезда, Яросл. губ. / Н. И. Шаханин. — Ярославль: Управл. Тип. ГСНХ, 1927. — 8 с.
4. Шаханин, Н. И. Дикорастущие лекарственные растения Ярославской области / Н. И. Шаханин. — Ярославль: Яросл. обл. изд., 1943. — 40 с.
5. Шаханин, Н. И. Ботанико-географическая характеристика Ярославской области / Н. И. Шаханин // Ученые записки ЯГПИ. — Ярославль, 1945. — Вып. 6(16). — С. 3—152.